48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1316 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  38.06 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  34.16 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  30.43 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1083 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  33.2 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  33.2 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  29.28 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  29.63 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  31 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  28.23 
 
 		 1051 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  28.91 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  27.17 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  27.56 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  29.12 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  26.29 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  28.52 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  28.91 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  32.14 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  28.32 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  29.54 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  25.93 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  28.25 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  27.38 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  26.12 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  24.89 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  22.67 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  23.42 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  23.02 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  22.99 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  22.1 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  23.08 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  23.08 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  22.78 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  23.79 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  22.04 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  24.79 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  27.27 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  20.9 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.62 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.05 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  22.64 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  19.03 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  27.52 
 
 		 434 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0398  hypothetical protein  30.38 
 
 		 455 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  22.22 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  35.09 
 
 		 438 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>