48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2703 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  41.1 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  38.02 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  30.19 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  32.08 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  31.56 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  26.74 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  28.24 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  27.54 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  29.63 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  29.7 
 
 		 1051 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  25.68 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  31.77 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  28.95 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  28.91 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  26.79 
 
 		 284 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  28.77 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  26.09 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  33.08 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  27.45 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  28.37 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  26.83 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  25.7 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  29.44 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  25.94 
 
 		 278 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.94 
 
 		 278 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  27.17 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1083 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  26.21 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  23.94 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  23.94 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  23.58 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  26.34 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.32 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  28.8 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  24.72 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  23.66 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  25.41 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  23.5 
 
 		 417 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  25.27 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  21.01 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  20.93 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  21.35 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  20.5 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  24.27 
 
 		 434 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  22.78 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  22.92 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>