62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1661 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  48.25 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  42.27 
 
 		 248 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  40.79 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  38.36 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  37.45 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  41.07 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  40.18 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  38.74 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  38.71 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  38.01 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  34.27 
 
 		 263 aa  164  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  29.46 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  36.26 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  25.1 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  22.56 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  24.05 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.11 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  23.94 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  29.52 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.58 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  25.7 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  26.49 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  28.93 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  27.13 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  27.6 
 
 		 1051 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  22.64 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  25.1 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  29.63 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  26.83 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  25.87 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  21.97 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  25.16 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  22.54 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  30.19 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  23.08 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  22.27 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  25.31 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  24.32 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  26.49 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  20 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  26.71 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  23.98 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23.98 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  24.22 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1083 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  24.22 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  24.22 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  24.82 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  24.22 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  24.22 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  21.47 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  24.22 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  24.22 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  26.32 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  24.22 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  22.28 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  22.14 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  23.68 
 
 		 317 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>