49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0539 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  54.85 
 
 		 263 aa  278  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  51.88 
 
 		 266 aa  268  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  48.2 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  45.66 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  42.15 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  29.66 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  29.63 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  31.66 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  33.67 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  30.68 
 
 		 1051 aa  95.5  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  30.91 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  30.04 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  30.91 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  30.05 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  29.32 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  29.48 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1083 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  28.72 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  29.59 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  26.94 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  25.44 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  27.37 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  25.87 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  27.54 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  29.17 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  24.12 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  32.97 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  24.55 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.62 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  23.64 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  28.71 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  29.19 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  20.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  24.15 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  20.9 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  26.88 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  21.52 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  22.31 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  32.98 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  24.47 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  25.86 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  24 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  23.16 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>