43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0676 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  47.58 
 
 
277 aa  255  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  48.13 
 
 
263 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  46.06 
 
 
266 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  45.78 
 
 
266 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  42.15 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  30.99 
 
 
261 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  30.53 
 
 
1051 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  31.12 
 
 
263 aa  102  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  31.42 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  33.91 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  29.44 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  28.19 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  28.44 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  31.27 
 
 
269 aa  82  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  26.96 
 
 
1083 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  28.76 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  29.96 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  28.51 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  27.47 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  29.89 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  24.56 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  29.14 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  28.65 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  25.43 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.43 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  27.14 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  28.38 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  25.58 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  23.68 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  22.46 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  24.05 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  21.79 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  23.71 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  26.53 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  24.37 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  22.96 
 
 
240 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  24.1 
 
 
439 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  24.1 
 
 
436 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0941  hypothetical protein  26.23 
 
 
441 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0564159  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  23.56 
 
 
417 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  21.88 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>