19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0941 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0941  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  908    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0564159  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  46.72 
 
 
419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  40.28 
 
 
421 aa  309  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  42.72 
 
 
417 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3223  hypothetical protein  33.02 
 
 
428 aa  210  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.254658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  27.85 
 
 
436 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  27.09 
 
 
439 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  25.41 
 
 
434 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  26.05 
 
 
438 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  26.29 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  25.96 
 
 
455 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  25.96 
 
 
455 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  24.78 
 
 
456 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  36.92 
 
 
261 aa  49.7  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  23.75 
 
 
455 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  22.1 
 
 
460 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  32.17 
 
 
263 aa  43.9  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  23.72 
 
 
462 aa  43.5  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  26.23 
 
 
271 aa  43.1  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.860563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>