92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2058 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  98.24 
 
 		 455 aa  921    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  933    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  72.85 
 
 		 453 aa  678    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  81.58 
 
 		 456 aa  788    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  68.86 
 
 		 451 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  68.42 
 
 		 451 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  57.73 
 
 		 462 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  54.7 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  53.95 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  53.95 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  53.73 
 
 		 454 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  53.73 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  54.17 
 
 		 454 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  53.07 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  53.51 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  53.73 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  53.51 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  52.41 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  53.51 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  53.51 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  52.63 
 
 		 454 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  53.07 
 
 		 454 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  54.39 
 
 		 454 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  53.73 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  52.19 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  52.65 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  52.43 
 
 		 455 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  52.43 
 
 		 455 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  51.32 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  51.33 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  52.69 
 
 		 451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  51.32 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  52.19 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  50.44 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  50.22 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  49.78 
 
 		 455 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  49.78 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  49.56 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  51.21 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  49.34 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  49.12 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  49.34 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  49.46 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  50.57 
 
 		 457 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  50.92 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  50.69 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  49.22 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  48.51 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  43.36 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  47.65 
 
 		 440 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  47.18 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  44.28 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  45.41 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  42.67 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  43.11 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  45.17 
 
 		 449 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  47.41 
 
 		 463 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  48.28 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  42.49 
 
 		 448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  42.14 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  47.76 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  42.26 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  41.57 
 
 		 448 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  38.95 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  40.41 
 
 		 460 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  40.91 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  41.71 
 
 		 444 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  37.95 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  41.76 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  36.87 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  40.05 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  41.73 
 
 		 455 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  38.13 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  38.13 
 
 		 474 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  37.41 
 
 		 521 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  37.23 
 
 		 456 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  38.61 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  35.41 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  35.41 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  38.8 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  36.93 
 
 		 453 aa  226  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  37.99 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  37.33 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  36.67 
 
 		 499 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  25.44 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  24.01 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  24.02 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  24.19 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  23.03 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  23.04 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0941  hypothetical protein  25.96 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0564159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  23.2 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>