91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2805 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  65.86 
 
 		 454 aa  634    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  65.86 
 
 		 454 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  937    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  66.08 
 
 		 454 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  64.76 
 
 		 455 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  65.86 
 
 		 454 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  66.08 
 
 		 454 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  67.62 
 
 		 454 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  65.42 
 
 		 454 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  65.86 
 
 		 454 aa  634  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  64.76 
 
 		 454 aa  629  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  64.54 
 
 		 454 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  64.54 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  64.76 
 
 		 454 aa  626  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  64.54 
 
 		 454 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  64.54 
 
 		 454 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  65.64 
 
 		 454 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  64.98 
 
 		 454 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  54.92 
 
 		 456 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  55.94 
 
 		 451 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  52.41 
 
 		 455 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  52.19 
 
 		 455 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  52.47 
 
 		 455 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  51.64 
 
 		 455 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  53.58 
 
 		 453 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  50.88 
 
 		 453 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  51.57 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  51.09 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  51.93 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  51.5 
 
 		 448 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  51.73 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  50.55 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  50.87 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  50 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  48.88 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  50.23 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  48.57 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  49.01 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  50 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  48.03 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  48.68 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  49.43 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  48.03 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  48.97 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  46.28 
 
 		 452 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  47.57 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  45.12 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  44.54 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  44.59 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  42.17 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  42.16 
 
 		 440 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  41.5 
 
 		 442 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  39.91 
 
 		 448 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  41.29 
 
 		 451 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  37.47 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  39.95 
 
 		 460 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  38.21 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  37.88 
 
 		 448 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  37.63 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  36.34 
 
 		 459 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  36.21 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  38.39 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  37.37 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  38.49 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  36.62 
 
 		 453 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  37.44 
 
 		 458 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  36.6 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  35.45 
 
 		 463 aa  262  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  37.12 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  35.51 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  34.05 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  34.36 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  35.34 
 
 		 499 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  35.34 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  34.06 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  34.06 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  35.25 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  33.66 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  31.44 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  33.41 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  35.34 
 
 		 499 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  34.04 
 
 		 456 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  31.71 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  25.57 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  25.64 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  26.5 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  23.41 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  25.08 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  28.67 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  22.64 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>