89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2163 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  919    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  55.53 
 
 		 448 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  54.82 
 
 		 448 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  54.82 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  53.1 
 
 		 452 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  52.88 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  45.17 
 
 		 455 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  44.72 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  42.7 
 
 		 453 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  47.38 
 
 		 458 aa  349  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  42.51 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  44.21 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  43.43 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  44.39 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  42.41 
 
 		 454 aa  330  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  42.19 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  42.93 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  40.64 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  41.96 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  39 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  39.04 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  40.94 
 
 		 454 aa  322  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  44.42 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  41.07 
 
 		 454 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  41.07 
 
 		 454 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  40.97 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  40.85 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  41.1 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  41.1 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  41.1 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  41.34 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  40.96 
 
 		 454 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  41.1 
 
 		 454 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  40.6 
 
 		 448 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  40.37 
 
 		 448 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  37.47 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  40.62 
 
 		 454 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  41.37 
 
 		 451 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  39.6 
 
 		 454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  41.36 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  39.96 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  38.96 
 
 		 457 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  38.93 
 
 		 451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  39.25 
 
 		 455 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  38.5 
 
 		 451 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  38.91 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  38.82 
 
 		 455 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  39.17 
 
 		 456 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  40.09 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  39.07 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  41.51 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  38.77 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  37.61 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  42.75 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  37.25 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  36.6 
 
 		 462 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  37.17 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  37.04 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  36.44 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  36.6 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  35.63 
 
 		 452 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  41.25 
 
 		 440 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  36.64 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  35.78 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  40.44 
 
 		 442 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  38.96 
 
 		 460 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  34.5 
 
 		 460 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  37.01 
 
 		 448 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  36.28 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  37.18 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  36.36 
 
 		 459 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  33.41 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  36.38 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  34.72 
 
 		 453 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  36.87 
 
 		 459 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  37.47 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  35.01 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  35.02 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  35.02 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  32.59 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  35.82 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  34.98 
 
 		 521 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  35.57 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  35.32 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  25.4 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  24.42 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  24.22 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  25.92 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  22.41 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>