86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2811 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  930    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  96.24 
 
 		 452 aa  876    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  52.88 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  48.48 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  47.79 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  47.43 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  40.89 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  45.03 
 
 		 453 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  47.61 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  46.72 
 
 		 455 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  45.24 
 
 		 456 aa  342  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  43.88 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  41.1 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  42.4 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  42.57 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  42.57 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  42.57 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  41.33 
 
 		 454 aa  336  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  42.35 
 
 		 454 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  42.35 
 
 		 454 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  42.35 
 
 		 454 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  42.35 
 
 		 454 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  41.59 
 
 		 454 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  41.91 
 
 		 454 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  41.1 
 
 		 454 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  41.79 
 
 		 453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  41.46 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  41.33 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  43.47 
 
 		 457 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  40.94 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  39.91 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  40.65 
 
 		 455 aa  322  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  40.3 
 
 		 455 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  40.93 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  39.31 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  41.08 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  39.55 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  38.68 
 
 		 454 aa  309  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  40.66 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  39.33 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  39.7 
 
 		 456 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  41.27 
 
 		 455 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  39.49 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  41.67 
 
 		 451 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  38.21 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  41.77 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  38.5 
 
 		 451 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  40.98 
 
 		 451 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  38.22 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  41.85 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  41.52 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  38.99 
 
 		 457 aa  299  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  39.69 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  39.19 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  39.53 
 
 		 454 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  38.68 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  39.53 
 
 		 454 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  44.61 
 
 		 440 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  44.75 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  39.66 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  39.36 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  39.67 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  36.78 
 
 		 452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  38.82 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  37.77 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  37.3 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  35.68 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  37.79 
 
 		 456 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  36.99 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  35.65 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  36.74 
 
 		 474 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  35.55 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  35.63 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  35.86 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  37.68 
 
 		 460 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  35.57 
 
 		 473 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  33.99 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  33.99 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  36.54 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  36.54 
 
 		 499 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  34.56 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  36.54 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  33.81 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  35 
 
 		 521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  22.64 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  23.88 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>