86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2167 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  956    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  39.14 
 
 		 460 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  39.14 
 
 		 460 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  40.87 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  37.55 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  40.22 
 
 		 451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  40.91 
 
 		 455 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  40.48 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  40.18 
 
 		 451 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  38.61 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  39.78 
 
 		 454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  38.48 
 
 		 454 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  39.12 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  39.18 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  39.18 
 
 		 454 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  39.18 
 
 		 454 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  39.18 
 
 		 454 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  38.49 
 
 		 453 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  39.18 
 
 		 454 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  38.96 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  39.21 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  38.96 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  38.23 
 
 		 454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  40.88 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  38.96 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  36.88 
 
 		 454 aa  280  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  36.93 
 
 		 451 aa  272  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  37.5 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  35.16 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  36.64 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  34.72 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  35.65 
 
 		 462 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  35.86 
 
 		 455 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  35.19 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  35 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  34.99 
 
 		 454 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  34.64 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  32.1 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  31.29 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  34.2 
 
 		 456 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  34.79 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  31.07 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  34.38 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  33.77 
 
 		 462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  34.56 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  34.01 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  34.15 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  33.62 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  33.26 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  34.9 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  33.26 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  32.95 
 
 		 448 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  32.59 
 
 		 449 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  32.95 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  33.19 
 
 		 452 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  34.85 
 
 		 451 aa  223  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  34.66 
 
 		 452 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  33.83 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  32.68 
 
 		 451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  31.9 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  31.41 
 
 		 448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  31.59 
 
 		 448 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  32.94 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  32.12 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  31.49 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  31.76 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  32.71 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  32.24 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  32.15 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  32.27 
 
 		 454 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  28.66 
 
 		 474 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  33.25 
 
 		 456 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  31.73 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  30.89 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  27.6 
 
 		 473 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  30.5 
 
 		 455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  27.58 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  30.03 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  30.03 
 
 		 499 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  30.14 
 
 		 521 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  27.88 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  27.88 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  29.22 
 
 		 499 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  29.65 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  23.72 
 
 		 421 aa  47.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  24.14 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>