87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3154 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  904    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  69.45 
 
 		 440 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  68.5 
 
 		 442 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  61.74 
 
 		 455 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  47.7 
 
 		 455 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  48.14 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  44.76 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  47.7 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  45.97 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  44.54 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  46.08 
 
 		 457 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  45.23 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  43.24 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  42.83 
 
 		 451 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  44.57 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  45.02 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  44.79 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  44.3 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  42.89 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  43.89 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  42.52 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  43.76 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  41.75 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  43.11 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  41.18 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  40.96 
 
 		 454 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  40.96 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  40.96 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  40.96 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  45.56 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  43.62 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  41.18 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  41.18 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  41.18 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  43.87 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  40.26 
 
 		 454 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  40.7 
 
 		 454 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  41.39 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  40.31 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  42.12 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  41.14 
 
 		 456 aa  346  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  39.87 
 
 		 454 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  38.95 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  39.91 
 
 		 453 aa  343  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  41.69 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  40.89 
 
 		 454 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  40.52 
 
 		 455 aa  339  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  40.44 
 
 		 451 aa  336  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  41.13 
 
 		 448 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  40.9 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  40.3 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  40.1 
 
 		 452 aa  315  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  38.79 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  36.75 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  37.47 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  38.41 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  35.71 
 
 		 459 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  39.95 
 
 		 448 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  37.95 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  39.48 
 
 		 448 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  33.99 
 
 		 451 aa  256  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  39.34 
 
 		 448 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  36.32 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  37.01 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  34.57 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  34.38 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 453 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  35.54 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  33.56 
 
 		 455 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  33.64 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  34.43 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  32.31 
 
 		 454 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  31.52 
 
 		 459 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  33.1 
 
 		 430 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  32.02 
 
 		 454 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  32.02 
 
 		 454 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  32.12 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  32.33 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  32.16 
 
 		 473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  32.41 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  32.26 
 
 		 499 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  32.64 
 
 		 499 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  31.24 
 
 		 521 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  22.88 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  21.9 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  25.86 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>