89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3779 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  68.42 
 
 		 455 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  68.64 
 
 		 455 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  68.2 
 
 		 456 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  930    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  85.37 
 
 		 451 aa  812    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  64.65 
 
 		 453 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  54.55 
 
 		 462 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  51.99 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  52.58 
 
 		 454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  52.58 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  52.58 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  52.93 
 
 		 454 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  52.7 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  52.93 
 
 		 454 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  52.93 
 
 		 454 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  51.91 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  50.55 
 
 		 453 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  50.56 
 
 		 454 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  49.45 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  51.64 
 
 		 454 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  50.81 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  48.67 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  47.79 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  45.81 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  47.3 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  45 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  47.28 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  45.11 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  45.2 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  44.84 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  44.4 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  47.02 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  45.59 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  45.9 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  44.35 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  44.18 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  44.79 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  44.81 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  46.9 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  44.07 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  44.34 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  44.21 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  41.57 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  46.81 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  46.57 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  44.32 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  42.92 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  44.37 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  42.12 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  41.84 
 
 		 461 aa  346  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  42.32 
 
 		 451 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  43.66 
 
 		 442 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  39.6 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  40.22 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  38.93 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  39.65 
 
 		 452 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  39.02 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  39.9 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  38.64 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  37.47 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  37.85 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  36.73 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  37.8 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  34.44 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  36.7 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  37.22 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  37.3 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  38.79 
 
 		 463 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  35.31 
 
 		 474 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  37.4 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  34.42 
 
 		 473 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  34.84 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  34.36 
 
 		 454 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  33.85 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 521 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  34.03 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  30.22 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  30.22 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  33.6 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  31.73 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  33.87 
 
 		 499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  26.62 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  20.23 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  24.17 
 
 		 417 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  20.62 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>