89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3920 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  911    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  96.21 
 
 
448 aa  851    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  95.31 
 
 
448 aa  843    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  53.67 
 
 
449 aa  518  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  47.32 
 
 
452 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  47.22 
 
 
452 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  45.97 
 
 
444 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  41.27 
 
 
455 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  41.27 
 
 
455 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  43.49 
 
 
453 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  41.39 
 
 
451 aa  332  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  40.8 
 
 
453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  44.67 
 
 
458 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  41.14 
 
 
454 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  39.39 
 
 
456 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  40.04 
 
 
454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  39.6 
 
 
454 aa  319  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  42.45 
 
 
453 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  43.81 
 
 
463 aa  318  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  39.6 
 
 
454 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  39.15 
 
 
454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  39.15 
 
 
454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  39.87 
 
 
457 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  38.26 
 
 
454 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  39.07 
 
 
455 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  38.48 
 
 
454 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  38.48 
 
 
454 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  38.48 
 
 
454 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  38.48 
 
 
454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  38.7 
 
 
454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  39.12 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  38.94 
 
 
456 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  38.43 
 
 
455 aa  302  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  38.94 
 
 
456 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  39.29 
 
 
455 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  39.86 
 
 
451 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  38.91 
 
 
451 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  40.6 
 
 
457 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  39.07 
 
 
455 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  38.41 
 
 
454 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  37.23 
 
 
453 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  36.91 
 
 
454 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  37.58 
 
 
454 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  37.96 
 
 
454 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  38.19 
 
 
454 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  40.13 
 
 
453 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  41.01 
 
 
455 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  37.67 
 
 
454 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  39.85 
 
 
453 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  37.97 
 
 
454 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  37.78 
 
 
453 aa  292  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  38.86 
 
 
451 aa  289  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  37.31 
 
 
454 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  38.64 
 
 
451 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  37.62 
 
 
462 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  37.33 
 
 
448 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  35.64 
 
 
462 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  37.47 
 
 
448 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  37.3 
 
 
456 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  37.3 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  36.91 
 
 
454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  36.63 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  36.26 
 
 
461 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  39.69 
 
 
448 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  41.24 
 
 
442 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  41.24 
 
 
440 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  34.34 
 
 
460 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  35.96 
 
 
460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  35.29 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  35.89 
 
 
456 aa  239  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  36.39 
 
 
455 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  35.33 
 
 
474 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  33.81 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  35.22 
 
 
473 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  35.59 
 
 
521 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  34.1 
 
 
453 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  32.07 
 
 
461 aa  216  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  36 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  35.98 
 
 
499 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  33.64 
 
 
459 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  33.02 
 
 
454 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  33.02 
 
 
454 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  33.33 
 
 
430 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  35.75 
 
 
499 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  22.52 
 
 
419 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  22.01 
 
 
439 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  23.08 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  22.11 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  25.87 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>