69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2465 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  858    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  51.89 
 
 
417 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  47.99 
 
 
419 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0941  hypothetical protein  40.1 
 
 
441 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0564159  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3223  hypothetical protein  30.92 
 
 
428 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.254658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  26.68 
 
 
436 aa  103  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  27.06 
 
 
434 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  25.6 
 
 
439 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  26.29 
 
 
438 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  23.97 
 
 
451 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  26.3 
 
 
453 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  24.62 
 
 
448 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  24.62 
 
 
448 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  24.42 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  23.03 
 
 
455 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  22.55 
 
 
261 aa  57.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0589  hypothetical protein  26.76 
 
 
435 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000090884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  29.45 
 
 
451 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  23.03 
 
 
455 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  26.02 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  26.74 
 
 
453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  25 
 
 
451 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0889  hypothetical protein  26.89 
 
 
459 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  22.51 
 
 
451 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  24.76 
 
 
451 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  24.1 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  22.15 
 
 
455 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  28.48 
 
 
452 aa  50.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  21.02 
 
 
455 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  22.54 
 
 
454 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  23.59 
 
 
453 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  26.01 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  26.01 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  22.8 
 
 
454 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  21.85 
 
 
454 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  27.66 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  24.78 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  25.66 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  27.78 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  22.25 
 
 
451 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  25.66 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  22.63 
 
 
456 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  25.66 
 
 
454 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  26.06 
 
 
453 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  28.67 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  23.72 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  22.86 
 
 
263 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  20.68 
 
 
462 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1159  hypothetical protein  27.5 
 
 
458 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  23.44 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  22.41 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1156  hypothetical protein  24.4 
 
 
459 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0583  hypothetical protein  22.87 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0261491  hitchhiker  0.00025912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  22.97 
 
 
454 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  26.57 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0594  hypothetical protein  23.4 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.666308  hitchhiker  0.00000927115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  23.88 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  25 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0591  hypothetical protein  25.82 
 
 
459 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  26.17 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  26.26 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  26.57 
 
 
460 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  25.5 
 
 
460 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  21.4 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  25.87 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  23.59 
 
 
462 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  27.27 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  22.34 
 
 
454 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  22.34 
 
 
454 aa  43.1  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>