26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0583 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0594  hypothetical protein  95.16 
 
 
455 aa  917    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.666308  hitchhiker  0.00000927115 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0583  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  951    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0261491  hitchhiker  0.00025912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0398  hypothetical protein  81.76 
 
 
455 aa  815    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0886  hypothetical protein  77.36 
 
 
455 aa  767    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109701  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1156  hypothetical protein  64.13 
 
 
459 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1159  hypothetical protein  52.74 
 
 
458 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0889  hypothetical protein  53.73 
 
 
459 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0591  hypothetical protein  52.85 
 
 
459 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0589  hypothetical protein  53.01 
 
 
435 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000090884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  26.76 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  24.61 
 
 
439 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  23.34 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  25.51 
 
 
499 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  25.22 
 
 
455 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  25 
 
 
453 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  25.42 
 
 
419 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  24.37 
 
 
454 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  24.37 
 
 
454 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  25.22 
 
 
499 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  23.81 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  25 
 
 
459 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  22 
 
 
434 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  22.87 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  24.4 
 
 
1083 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  24.49 
 
 
438 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  24.8 
 
 
521 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>