23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1159 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  941    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0889  hypothetical protein  64.25 
 
 		 459 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0591  hypothetical protein  63.38 
 
 		 459 aa  628  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0589  hypothetical protein  63.11 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1156  hypothetical protein  55.99 
 
 		 459 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0398  hypothetical protein  54.27 
 
 		 455 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0594  hypothetical protein  52.52 
 
 		 455 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.666308  hitchhiker  0.00000927115 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0583  hypothetical protein  52.74 
 
 		 455 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0261491  hitchhiker  0.00025912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0886  hypothetical protein  49.89 
 
 		 455 aa  494  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  25.7 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  24.14 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  25.34 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  25 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  24.7 
 
 		 499 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  24.12 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  24.62 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  25.25 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  24.92 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  24.92 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  25.31 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  23.48 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  27.5 
 
 		 421 aa  47  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  24.7 
 
 		 499 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>