21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0886 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0594  hypothetical protein  77.36 
 
 
455 aa  768    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.666308  hitchhiker  0.00000927115 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0583  hypothetical protein  77.36 
 
 
455 aa  767    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0261491  hitchhiker  0.00025912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0398  hypothetical protein  81.98 
 
 
455 aa  808    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0886  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  950    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109701  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1156  hypothetical protein  61.66 
 
 
459 aa  607  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0889  hypothetical protein  50.66 
 
 
459 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1159  hypothetical protein  49.89 
 
 
458 aa  494  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0591  hypothetical protein  49.12 
 
 
459 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0589  hypothetical protein  50.23 
 
 
435 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000090884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  25.88 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  24.61 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  25.07 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  27.91 
 
 
499 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  27.52 
 
 
455 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  22.78 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  24.02 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  22.69 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  27.52 
 
 
499 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  24.25 
 
 
430 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.67 
 
 
1083 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  25.66 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>