92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6388 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  82.09 
 
 		 454 aa  763    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  78.32 
 
 		 499 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  78.32 
 
 		 499 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  76.98 
 
 		 453 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  72.03 
 
 		 459 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  79.02 
 
 		 455 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  896    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  82.09 
 
 		 454 aa  763    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  52.35 
 
 		 455 aa  465  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  53.01 
 
 		 474 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  51.15 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  51.17 
 
 		 521 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  49.65 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  35.55 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  34.86 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  34.84 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  37.47 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  32.41 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  38.73 
 
 		 455 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  35.27 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  37.99 
 
 		 455 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  34.97 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  34.11 
 
 		 455 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  34.39 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  34.49 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  33.56 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  33.75 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  32.79 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  33.41 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  32.79 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  32.71 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  32.79 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  36.17 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  33.18 
 
 		 442 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  33.84 
 
 		 453 aa  209  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  33.17 
 
 		 453 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  32.04 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  34.07 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  31.14 
 
 		 451 aa  206  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  33.79 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  35.1 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  33.58 
 
 		 463 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  29.68 
 
 		 453 aa  203  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  33.1 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  33.6 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  33.25 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  33 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  34.48 
 
 		 456 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  31.29 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  33.74 
 
 		 456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  33.91 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  31.96 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  33.17 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  32.92 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  30.72 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  30.54 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  31.97 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  31.87 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  34.07 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  31.19 
 
 		 454 aa  192  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  30.95 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  30.96 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  32.17 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  30.59 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  34.67 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  32.28 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  31.19 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  30.72 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  31.73 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  33.09 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  31.36 
 
 		 459 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  29.67 
 
 		 457 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  30.41 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  30.41 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  30.41 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  33.88 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  30.18 
 
 		 454 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  31.77 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  32.11 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  31.07 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  30.18 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  30.05 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  29.65 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  23.09 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  22.33 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  21.81 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  22.82 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0583  hypothetical protein  23.81 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0261491  hitchhiker  0.00025912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0398  hypothetical protein  25 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0886  hypothetical protein  24.25 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0594  hypothetical protein  22.69 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.666308  hitchhiker  0.00000927115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>