91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2224 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  81.94 
 
 		 454 aa  794    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  84.14 
 
 		 454 aa  827    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  83.48 
 
 		 454 aa  822    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  83.48 
 
 		 454 aa  821    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  942    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  83.26 
 
 		 454 aa  820    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  76.43 
 
 		 454 aa  743    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  81.94 
 
 		 454 aa  809    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  83.04 
 
 		 454 aa  810    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  81.28 
 
 		 454 aa  802    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  81.5 
 
 		 454 aa  806    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  81.94 
 
 		 454 aa  809    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  79.3 
 
 		 454 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  82.6 
 
 		 454 aa  815    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  81.94 
 
 		 454 aa  809    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  81.28 
 
 		 454 aa  775    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  65.64 
 
 		 453 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  63 
 
 		 455 aa  615  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  56.19 
 
 		 451 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  54.61 
 
 		 455 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  54.39 
 
 		 455 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  54.7 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  54.34 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  54.27 
 
 		 453 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  52.54 
 
 		 455 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  52.74 
 
 		 455 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  51.43 
 
 		 453 aa  461  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  52.93 
 
 		 454 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  52.84 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  52.06 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  52.06 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  49.56 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  51.33 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  49.77 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  51.41 
 
 		 454 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  50 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  49.89 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  49.34 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  49.56 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  50.55 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  49.89 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  49.66 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  50.34 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  46.97 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  49.23 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  48.35 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  48.03 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  44.37 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  47.45 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  45.2 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  43.33 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  45.67 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  45.43 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  41.83 
 
 		 448 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  42.04 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  40.04 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  39.81 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  38.7 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  39.5 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  39.35 
 
 		 452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  38.98 
 
 		 448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  38.75 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  41.04 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  38.28 
 
 		 448 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  38.48 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  39.78 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  37.47 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  36.75 
 
 		 454 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  36.55 
 
 		 463 aa  275  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  38.53 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  36.74 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  37.3 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  35.73 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  35.15 
 
 		 473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  35.06 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  34.41 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  33.18 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  33.18 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  32.19 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  34.75 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  31.41 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  35.01 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  31.87 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  34.75 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  25.94 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  22.96 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  24.41 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  24.28 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  22.96 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  23.88 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  23.3 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>