91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1363 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  929    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  46.05 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  44.54 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  42.67 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  43.23 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  44.32 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  43.45 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  42.23 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  42.23 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  42.67 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  45.06 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  42.23 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  42.23 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  41.79 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  43.33 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  44.85 
 
 		 455 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  43.61 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  42.89 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  41.79 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  41.79 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  44.13 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  42.67 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  41.79 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  41.36 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  41.83 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  40.92 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  42.08 
 
 		 456 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  43.11 
 
 		 456 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  41.36 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  41.38 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  42.05 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  39.74 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  42.38 
 
 		 447 aa  349  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  40.96 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  43.78 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  40.7 
 
 		 454 aa  346  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  40.74 
 
 		 454 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  38.68 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  40.31 
 
 		 454 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  41.83 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  40.48 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  40.96 
 
 		 448 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  41.61 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  40.96 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  42.24 
 
 		 457 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  41.22 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  40.61 
 
 		 453 aa  329  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  41.3 
 
 		 452 aa  326  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  39.6 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  40.22 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  38.5 
 
 		 451 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  39.56 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  35.96 
 
 		 440 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  36.04 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  33.99 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  35.9 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  35.68 
 
 		 452 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  33.41 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  35.36 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  33.26 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  34.09 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  34.34 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  34.6 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  32.8 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  33.26 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  30.82 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  31.17 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  32.04 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  32.68 
 
 		 461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  30.9 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  32.49 
 
 		 473 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  30.57 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  31.85 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  31.37 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  33.49 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  30.38 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  29.1 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  29.1 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  29.97 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  29.2 
 
 		 455 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  28.97 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  30.05 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  27.59 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  28.74 
 
 		 499 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  23.97 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  22.22 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  26.04 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3223  hypothetical protein  25 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.254658  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  22.07 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  21.39 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  24.78 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>