90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19830 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  69.01 
 
 
454 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  98.68 
 
 
456 aa  929    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  69.58 
 
 
455 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  68.13 
 
 
454 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  71.15 
 
 
457 aa  704    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  81.37 
 
 
455 aa  787    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  73.62 
 
 
457 aa  688    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  68.57 
 
 
454 aa  656    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  68.71 
 
 
455 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  941    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  67.47 
 
 
454 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  65.64 
 
 
454 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  64.32 
 
 
456 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  64.1 
 
 
462 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  59.96 
 
 
453 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  56.8 
 
 
453 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  52.85 
 
 
455 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  52.14 
 
 
451 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  52.53 
 
 
453 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  51.99 
 
 
455 aa  472  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  51.53 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  51.09 
 
 
454 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  51.09 
 
 
456 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  49.78 
 
 
454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  49.78 
 
 
454 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  49.34 
 
 
454 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  49.34 
 
 
454 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  49.56 
 
 
454 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  49.13 
 
 
454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  49.78 
 
 
454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  48.69 
 
 
454 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  48.69 
 
 
454 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  48.69 
 
 
454 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  48.03 
 
 
453 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  49.34 
 
 
454 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  49.34 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  48.25 
 
 
454 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  48.25 
 
 
454 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  49.34 
 
 
455 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  49.54 
 
 
454 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  49.65 
 
 
440 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  44.54 
 
 
448 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  49.42 
 
 
442 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  47.16 
 
 
454 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  48.85 
 
 
453 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  44.07 
 
 
451 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  43.83 
 
 
451 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  43.45 
 
 
462 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  43.63 
 
 
452 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  43.43 
 
 
447 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  42.5 
 
 
461 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  43.74 
 
 
448 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  43.51 
 
 
448 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  41.61 
 
 
451 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  39.79 
 
 
451 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  39.69 
 
 
460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  39.52 
 
 
459 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  40.46 
 
 
448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  39.31 
 
 
448 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  39.17 
 
 
449 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  40.04 
 
 
452 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  39.31 
 
 
448 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  36.76 
 
 
460 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  39.15 
 
 
452 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  39.73 
 
 
458 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  39 
 
 
444 aa  266  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  40.78 
 
 
463 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  39.44 
 
 
453 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  36.82 
 
 
453 aa  256  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  37 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  31.07 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  35.91 
 
 
474 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  36.67 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  35.41 
 
 
455 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  36.36 
 
 
473 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  33.62 
 
 
521 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  31.88 
 
 
454 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  31.88 
 
 
454 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  33.03 
 
 
459 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  34.07 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  34.57 
 
 
499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  33.83 
 
 
499 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  33.74 
 
 
430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  33.25 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  25.82 
 
 
434 aa  54.7  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  21.95 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  26.01 
 
 
421 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  29.73 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  24.73 
 
 
436 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  26.44 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>