87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2810 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2810  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  981    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2751  hypothetical protein  72.78 
 
 		 474 aa  742    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0150092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  55.19 
 
 		 521 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  54.19 
 
 		 455 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  50.89 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  50.89 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  51.27 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  51.15 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  49.31 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  48.85 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  48.27 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  49.08 
 
 		 499 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4870  hypothetical protein  43.02 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  36.06 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2058  hypothetical protein  38.13 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2627  hypothetical protein  35.91 
 
 		 453 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24300  hypothetical protein  37.89 
 
 		 455 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.147167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2319  hypothetical protein  36.34 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2163  hypothetical protein  36.38 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3166  hypothetical protein  36.64 
 
 		 451 aa  243  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1806  hypothetical protein  35.29 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00564831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4165  hypothetical protein  36.17 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3433  hypothetical protein  35.22 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1939  hypothetical protein  35.08 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.203598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2811  hypothetical protein  35.6 
 
 		 452 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1726  hypothetical protein  35.16 
 
 		 454 aa  236  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2224  hypothetical protein  36.16 
 
 		 454 aa  236  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0337124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3659  hypothetical protein  35.39 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.823343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2937  hypothetical protein  35.63 
 
 		 456 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2137  hypothetical protein  35.39 
 
 		 454 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.181142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2668  hypothetical protein  35.36 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4060  protein of unknown function DUF1329  36.79 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2805  hypothetical protein  34.36 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0131  hypothetical protein  35.33 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2198  hypothetical protein  33.4 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.394544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1699  hypothetical protein  34.52 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4027  protein of unknown function DUF1329  36.3 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0223  hypothetical protein  35.1 
 
 		 453 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0482  hypothetical protein  34.13 
 
 		 448 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1589  hypothetical protein  34.04 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0393574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05010  hypothetical protein  33.89 
 
 		 448 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3779  hypothetical protein  34.42 
 
 		 451 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3920  hypothetical protein  35.8 
 
 		 448 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1752  hypothetical protein  33.89 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127551  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2479  hypothetical protein  35.41 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00147057  normal  0.0236321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0992  hypothetical protein  35.8 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2596  hypothetical protein  33.41 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1185  hypothetical protein  35.68 
 
 		 455 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1677  hypothetical protein  33.81 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00882036  normal  0.128248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1782  hypothetical protein  33.81 
 
 		 454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00144157  normal  0.133071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0906  hypothetical protein  35.46 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1150  hypothetical protein  35.07 
 
 		 462 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  34.12 
 
 		 454 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2436  hypothetical protein  33.18 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.351127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2443  hypothetical protein  33.18 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.714967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2556  hypothetical protein  33.18 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0832128  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1705  hypothetical protein  36.36 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13140  hypothetical protein  35.21 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2003  hypothetical protein  32.51 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1908  protein of unknown function DUF1329  33.57 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000328398  normal  0.130945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3146  hypothetical protein  34.74 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 456 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0854065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4707  hypothetical protein  34.91 
 
 		 454 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0317373  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0965  hypothetical protein  34.54 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0447292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2694  hypothetical protein  32.65 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0223817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1135  hypothetical protein  34.1 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.621628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2007  hypothetical protein  31.91 
 
 		 461 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1719  hypothetical protein  34.27 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6865  hypothetical protein  34.57 
 
 		 453 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119627  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1999  hypothetical protein  33.41 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00460648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1460  hypothetical protein  30.95 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673906  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0807  hypothetical protein  35.76 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2247  hypothetical protein  35.9 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000648167  hitchhiker  5.11775e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0766  hypothetical protein  34.98 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2066  hypothetical protein  32.7 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4423  hypothetical protein  34.74 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4262  hypothetical protein  29.89 
 
 		 459 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0793  hypothetical protein  34.51 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520529  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3699  hypothetical protein  35.43 
 
 		 440 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1363  hypothetical protein  32.49 
 
 		 451 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2043  hypothetical protein  34.92 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3154  hypothetical protein  32.16 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1519  hypothetical protein  31.93 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2167  hypothetical protein  27.6 
 
 		 461 aa  162  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  24.14 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  23.6 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  21.43 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>