27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0398 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1156  hypothetical protein  65.14 
 
 		 459 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0594  hypothetical protein  82.42 
 
 		 455 aa  816    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.666308  hitchhiker  0.00000927115 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0583  hypothetical protein  81.76 
 
 		 455 aa  815    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0261491  hitchhiker  0.00025912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0398  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  948    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0886  hypothetical protein  81.98 
 
 		 455 aa  808    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1159  hypothetical protein  54.27 
 
 		 458 aa  538  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0889  hypothetical protein  53.73 
 
 		 459 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0591  hypothetical protein  52.3 
 
 		 459 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0589  hypothetical protein  53.47 
 
 		 435 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  27.79 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  26.08 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5818  hypothetical protein  26.74 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  24.64 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4361  hypothetical protein  26.45 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5042  hypothetical protein  26.45 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.218422  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6838  hypothetical protein  25.5 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0670921  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1083 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4323  protein of unknown function DUF1329  24.51 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.940807  normal  0.0836825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4433  protein of unknown function DUF1329  24.51 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.445109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  23.21 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6388  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0193675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  24.22 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6783  hypothetical protein  24.09 
 
 		 521 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4348  hypothetical protein  25.07 
 
 		 459 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.277316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  30.38 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  23.55 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2973  protein of unknown function DUF1329  26.32 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.96658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>