69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2009 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  533  1e-150  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  45.11 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  39.23 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  34.41 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  32.93 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  31.94 
 
 		 1051 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1083 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  34.13 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  36.36 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  28.68 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  32.33 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  30.43 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  31.95 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  34.41 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  31.13 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  29.87 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  29.66 
 
 		 269 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.63 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  27.45 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  25.63 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  27.89 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  27.49 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  27.98 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  30.22 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  27.67 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  26.38 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  27.97 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  26.29 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  30.36 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  32.71 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  26.89 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  26.89 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.09 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  29 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  26.54 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  26.56 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  25.78 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  28.19 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  27.9 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  27.03 
 
 		 267 aa  72  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  27.31 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  27.22 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  25.12 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  22.55 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  22.93 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  23.83 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3776  hypothetical protein  23.79 
 
 		 438 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000251059  hitchhiker  0.00347498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  22.78 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  21.88 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0941  hypothetical protein  36.92 
 
 		 441 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0564159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  22.54 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  21.24 
 
 		 434 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  31.18 
 
 		 330 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3302  hypothetical protein  22.58 
 
 		 439 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2268  hypothetical protein  22.91 
 
 		 436 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4689  hypothetical protein  36.51 
 
 		 419 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  19.77 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  24.79 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0235  hypothetical protein  21.68 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.129282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  25.35 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  24.04 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  24.04 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  24.04 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  26.42 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  21.83 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  24.04 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  24.04 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0647  hypothetical protein  20.08 
 
 		 454 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000512511  normal  0.400401 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  24.04 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>