40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0959 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1083 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  27.87 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  27.21 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  27.94 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  28.09 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  25.1 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  27.24 
 
 		 262 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  27.01 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  27.46 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  24.81 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  27.31 
 
 		 1051 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  27.05 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  27.93 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  26.38 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  23.51 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  29.29 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  24.38 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  25.71 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  23.91 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  25.37 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  26.34 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  25.13 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.13 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  26.36 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  27.1 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  20.48 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  25.32 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.43 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  22.32 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  26.85 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  22.22 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  24.2 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  22.58 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  29.01 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  21.2 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  28.26 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  20.08 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>