54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1179 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  44.15 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  38.4 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  39.63 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  33.74 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  32.66 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1083 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  33.07 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  34.21 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  33.73 
 
 		 262 aa  131  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  29.66 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  29.7 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  31.84 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  32.49 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  31.02 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  32.08 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  31.44 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  27.63 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  32.67 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  29 
 
 		 1051 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  31.22 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  29.52 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  31.8 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  31.12 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  29.02 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  29.86 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  30.77 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  30.77 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.74 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  33.67 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  26.84 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  29.66 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.88 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  26.15 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  26.88 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  26.2 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  31.1 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  25.67 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  29.14 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  23.4 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  25.77 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  26.25 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  23.69 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  23.91 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  25 
 
 		 434 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  28.39 
 
 		 417 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  26.32 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0941  hypothetical protein  32.17 
 
 		 441 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0564159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  25.64 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  20.36 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  22.77 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  20.24 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>