45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1800 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  57.02 
 
 
238 aa  286  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  27.92 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  25.4 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  27.42 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  30.13 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  27.07 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  26.6 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  24.74 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  28.75 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  28.36 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  25.55 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  24.11 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  25.45 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1097  hypothetical protein  28.67 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000255633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  25.21 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000977  hypothetical protein  26.63 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07027  hypothetical protein  25.87 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0384  hypothetical protein  23.73 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  27.44 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2439  hypothetical protein  24.78 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  24.42 
 
 
260 aa  58.5  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  22.27 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  22.27 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  24.46 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  23.69 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19650  hypothetical protein  24.44 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  24.39 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  22.87 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  24.39 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  24.39 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  24.39 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  24.39 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  24.39 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  24.39 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  24.39 
 
 
260 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  23.78 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  25.41 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1849  hypothetical protein  23.63 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  20.49 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  22.07 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0717  hypothetical protein  26.09 
 
 
301 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2529  hypothetical protein  25.2 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0517946  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  25.41 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0498  hypothetical protein  25.41 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.432294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>