15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1553 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1553  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165231  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1593  hypothetical protein  86.26 
 
 
371 aa  593  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4840  hypothetical protein  44.93 
 
 
367 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3424  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  42.37 
 
 
381 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0385  hypothetical protein  38.67 
 
 
384 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01680  hypothetical protein  33.67 
 
 
396 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.607562  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0752  hypothetical protein  30.56 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6299  hypothetical protein  30.03 
 
 
324 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1293  hypothetical protein  33.15 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.896512  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0930  hypothetical protein  31.03 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0857  hypothetical protein  27.69 
 
 
395 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  0.0121379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3302  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  34.31 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.663366  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1207  hypothetical protein  25.92 
 
 
392 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.556738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5741  hypothetical protein  27.36 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  25.85 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>