22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1869 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  35.24 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.84 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  26.92 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.02 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1085  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.65 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  22.6 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0184  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.46 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.12 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.54 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.5 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  24.12 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  25.97 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  26.09 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2190  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.74 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.806503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  26.23 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.14 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6863  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.52 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  20.31 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  20.31 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.58 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.730307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>