60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5101 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  91.67 
 
 		 204 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  70.3 
 
 		 200 aa  266  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  39.77 
 
 		 195 aa  121  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  34.3 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  30.11 
 
 		 228 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  30.77 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  31.46 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  35.2 
 
 		 173 aa  91.3  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.65 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  32.92 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  28 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  28 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.95 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  27.27 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  28.82 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  29.41 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  32.66 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.36 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.12 
 
 		 257 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  27.23 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.42 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.96 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.59 
 
 		 248 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  28.72 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  25.97 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.35 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  28.93 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  27.75 
 
 		 267 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  27.75 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  27.22 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  27.5 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  27.04 
 
 		 271 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  27.04 
 
 		 271 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  24.34 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  27.22 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  27.91 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  26.47 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  26.47 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  26.6 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1495  hypothetical protein  29.69 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.635359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  24.86 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  24.85 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.44 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  27.03 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  25.13 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  23.53 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  26.09 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  26.59 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  23.3 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  25.39 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  22.84 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  25.39 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  23.81 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.66 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  20 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  26.95 
 
 		 204 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  27.75 
 
 		 228 aa  42  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>