61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4808 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  85.95 
 
 
201 aa  328  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  57.29 
 
 
201 aa  243  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  54.73 
 
 
201 aa  223  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  36.32 
 
 
206 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  34.5 
 
 
206 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.49 
 
 
209 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.68 
 
 
209 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.81 
 
 
248 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  31.54 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  31.54 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  28.4 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.73 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  30.05 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  27.22 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.82 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  28.78 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  32.63 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  27.47 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  30.72 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  29.35 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  28.22 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  30.72 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  28.8 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  31.05 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  31.28 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  30.19 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  27.22 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  31.28 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  30.06 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  30.91 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  29.01 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  29.01 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  23.16 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  30.38 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  25.95 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  27.32 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  30.91 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  30.91 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  27.67 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  28.48 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  22.99 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  24.71 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  27.84 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  25.57 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  25.17 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  28.65 
 
 
271 aa  58.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  23.43 
 
 
172 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  23.67 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1495  hypothetical protein  25.31 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.635359  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  27.01 
 
 
267 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  27.47 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  22 
 
 
181 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0433  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.98 
 
 
192 aa  47  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  21.47 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  24.43 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  24.43 
 
 
238 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  22.97 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.13 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  24.14 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  21.6 
 
 
228 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>