41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0333 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  90 
 
 		 272 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  87.5 
 
 		 272 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  77.03 
 
 		 276 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  71.08 
 
 		 255 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  68.66 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  68.66 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  70.8 
 
 		 256 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  71.93 
 
 		 267 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  46.98 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  43.67 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.89 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  40.29 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.74 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  37.89 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  28.12 
 
 		 232 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.23 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  25.55 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  28.8 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  30.88 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  25.98 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.24 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.64 
 
 		 200 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  28.16 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  25.44 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  28.16 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.84 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.44 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.41 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  25.67 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.94 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  26.24 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  27.22 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  25.6 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  27.52 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  27.04 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  25 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  24.18 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  21.05 
 
 		 173 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.72 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  24.1 
 
 		 198 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>