66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004072 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  46.31 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.54 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.89 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.78 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.5 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.48 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.68 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.38 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  32.98 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  31.05 
 
 		 243 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.73 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.77 
 
 		 248 aa  94.7  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  30.46 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  29.38 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  29.38 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  32.6 
 
 		 270 aa  85.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  29.03 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  31.98 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  29.61 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  27.84 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  32.18 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  29.61 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  29.35 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  26.51 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  31.21 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  25.9 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  29.17 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  32.31 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  29.28 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  30.88 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  29.56 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  28.48 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  29.56 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  23.93 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  24.86 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  26.59 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  28.48 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1495  hypothetical protein  23.81 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.635359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  22.84 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  24.24 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.1 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  21.08 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.12 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  21.52 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.34 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  24.14 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  24.14 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  22.78 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  19.51 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  23.03 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  24.54 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  20.6 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3596  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.83 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  21.57 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  23.46 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.67 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  21.76 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  23.23 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  21.15 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  20.38 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  28 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>