61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3519 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  47.66 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  50.75 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  41.74 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  41.13 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  41.91 
 
 		 276 aa  151  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  42.47 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  39.92 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  39.92 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  41.9 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  42.08 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  35.21 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  34.76 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  32.56 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  31.35 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  34.38 
 
 		 206 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  34.52 
 
 		 222 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.59 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  30.32 
 
 		 206 aa  86.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  30.49 
 
 		 225 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  31.48 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  29.27 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  30.18 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.15 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  30.26 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  30.26 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.93 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.39 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  28.66 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.61 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  27.12 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.43 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.82 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  27.22 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  26.47 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  25.15 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.85 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  26.9 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  25.75 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  26.06 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  29.89 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  26.04 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  25.45 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  24.85 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  24.85 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  28.43 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  25.88 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  24.66 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  25.32 
 
 		 173 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  26.51 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  26.51 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  23.03 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1495  hypothetical protein  25.64 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.635359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  25.97 
 
 		 172 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  27.1 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  23.98 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  24.43 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.15 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.04 
 
 		 216 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>