48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1986 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.84 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  29.17 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  26.16 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  25.62 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  25.62 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  21.46 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  24.75 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  25.32 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  24.68 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  24.03 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  24 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.85 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.7 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  23.47 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  23.17 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.95 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  25.39 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0184  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.79 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.29 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  25.62 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  24.1 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1085  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  19.65 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.16 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  26.53 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  23.29 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.87 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  20.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  22.29 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.56 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  27.7 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  20.93 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.05 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  21.19 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.65 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  23.95 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.76 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  25.48 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.47 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  21.21 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  27.59 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  24.52 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.55 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  25.58 
 
 		 225 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  19.87 
 
 		 189 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  24.4 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>