51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3930 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  61.11 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  61.11 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  64.24 
 
 		 220 aa  227  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  62.64 
 
 		 214 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  61.49 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  59.14 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  59.41 
 
 		 211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  60.74 
 
 		 198 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  55.88 
 
 		 210 aa  201  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  51.91 
 
 		 194 aa  185  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  53.67 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  45.45 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  40.32 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  40.32 
 
 		 238 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  44.38 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  37.85 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  42.17 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  30.06 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  32.08 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  29.49 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  28.85 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  29.57 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.93 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.75 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  29.02 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  29.02 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.41 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  29.05 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  28.24 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  29.29 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.18 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  23.56 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  26.95 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  23.53 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  22.09 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  26.06 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.71 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  25.16 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  24.57 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.29 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  24.65 
 
 		 173 aa  45.4  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  21.15 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  22.78 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.47 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.17 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.94 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.62 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>