41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03732 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  100 
 
 
215 aa  430  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  56.25 
 
 
180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  57.65 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  31.71 
 
 
194 aa  79  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  32.7 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  31.01 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  32.08 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  30.57 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  30.89 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  29.61 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  27.33 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  32.87 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  32.1 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  32.1 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  31.48 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  28.74 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  32.03 
 
 
181 aa  61.6  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  30.67 
 
 
220 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  29.11 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  28.4 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  28.4 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  28.4 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  23.16 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  28.14 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.39 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  23.16 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  26.51 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  25.27 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  20 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  20.6 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.37 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  26.7 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  26.7 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  26.54 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  25.34 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  25 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.98 
 
 
257 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  25.93 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.36 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  25.61 
 
 
196 aa  41.6  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>