64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4576 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  62.24 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  62.3 
 
 		 201 aa  242  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  57.29 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  37.56 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  38.89 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.04 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.12 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  30.61 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  29.93 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  30.05 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.46 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.61 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  29.14 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  30.14 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.32 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  29.44 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  29.44 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  23.91 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  29.88 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  27.03 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1495  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.635359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  26.88 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  23.87 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  28.84 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  28.92 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  22.58 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  28.84 
 
 		 272 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  29.13 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  27.09 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  27.4 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  27.4 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  28.79 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  28.37 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  28.81 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  26.01 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  26.01 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  29.29 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  28.3 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  22.64 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  27.53 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  25.97 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  26.19 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  25.69 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  27.03 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0433  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.98 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  23.31 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  22.64 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  23.42 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  23.37 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  21.57 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  24.83 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.7 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  23.3 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  23.3 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  24.7 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.55 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  26.37 
 
 		 214 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2128  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.63 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000303746  normal  0.0168034 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  21.26 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>