43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1321 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  63.43 
 
 		 204 aa  224  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  44.38 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  43.03 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  41.86 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  39.89 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  42.51 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  40.45 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  42.46 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  35.76 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  38.62 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  39.88 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  38.83 
 
 		 197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  40.12 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  39.26 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  37.57 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  37.57 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  36.99 
 
 		 199 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  29.01 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  31.54 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  31.88 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  27.33 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  27.61 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.43 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.25 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  23.3 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.43 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  21.95 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3177  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.53 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  23.24 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.95 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  23.16 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  23.24 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  21.13 
 
 		 187 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.8 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.75 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.19 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.43 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  20.38 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  23.73 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  23.08 
 
 		 228 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>