79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3915 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.22 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  30.43 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  28.78 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.6 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.66 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  29.51 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.79 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.49 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.16 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.82 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  31.61 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  31.94 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  31.94 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  30.54 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  29.31 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  28.88 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  35.8 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  29.29 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  29.68 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  27.54 
 
 		 270 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  29.9 
 
 		 267 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  30.41 
 
 		 255 aa  89  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.59 
 
 		 257 aa  88.6  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  29.25 
 
 		 271 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  29.25 
 
 		 271 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  32.24 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  28.86 
 
 		 280 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  25.32 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  25.14 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  30.2 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  27.86 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  28.36 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  28.88 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  28.22 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  29.22 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  25.3 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1495  hypothetical protein  31.38 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.635359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  28.49 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  25.15 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  29.31 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  28.92 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  27.92 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  27.78 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  28.49 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  29.02 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  29.02 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  28.32 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  26.32 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  25.77 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.16 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  21.85 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.5 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  23.4 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  23.4 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  24.68 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0433  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.32 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.59 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  27.18 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  20.83 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.81 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.35 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.81 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.35 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  28.07 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.8 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3596  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.52 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.35 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  28.07 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.05 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.61 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  29.17 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  21.47 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.71 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  26.92 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.71 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  32.53 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.13 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>