55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3982 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  100 
 
 		 197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  54.97 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  51.48 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  45.65 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  48.48 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  50.63 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  43.96 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  41.27 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  41.27 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  43.96 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  45.25 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  45.71 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  47.02 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  46.67 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  45.14 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  40.21 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  42.26 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  37.78 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  38.83 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  38.55 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.12 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  23.93 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.91 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.78 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  29.61 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  26.99 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  26.99 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.16 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  22.91 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  23.46 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.39 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  26.67 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  27.2 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.18 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  24.86 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.66 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  23.12 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  23.59 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.49 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  28.15 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  22.93 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.61 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  23.53 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  20.74 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.48 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.94 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  20.56 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  23.4 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  21.21 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  21.88 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1039  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.66 
 
 		 244 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236245  normal  0.725621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  23.49 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  21.47 
 
 		 270 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3440  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.95 
 
 		 244 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>