55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1375 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  69.19 
 
 		 210 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  56.59 
 
 		 202 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  53.04 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  53.04 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  57.31 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  57.06 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  56.29 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  56.17 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  49.46 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  53.18 
 
 		 214 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  51.3 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  50.91 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  50.54 
 
 		 197 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  50.28 
 
 		 181 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  44.06 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  45.11 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  42.78 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  41.72 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  41.36 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  27.49 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  31.01 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.27 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  24.04 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.11 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  26.35 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  29.52 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  27.01 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  26.83 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  26.83 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  28.14 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.32 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  26.81 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  26.35 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  28.32 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.15 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.46 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.13 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  20.11 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  24.38 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  23.33 
 
 		 270 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  27.17 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  25 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  24.39 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.17 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.42 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  22.99 
 
 		 172 aa  48.5  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.73 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  18.86 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  26.95 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  24.6 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  27.7 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.99 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  27.17 
 
 		 267 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  25.31 
 
 		 256 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>