61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0306 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  98.48 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  83.05 
 
 		 214 aa  304  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  83.05 
 
 		 214 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  77.47 
 
 		 213 aa  293  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  77.47 
 
 		 213 aa  293  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  81.07 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  78.79 
 
 		 211 aa  280  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  59.89 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  50.91 
 
 		 216 aa  187  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  48.52 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  43.21 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  40 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  42.13 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  40.22 
 
 		 186 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  40.22 
 
 		 238 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  39.13 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  36.16 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  34.97 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  31.36 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  31.41 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.83 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.9 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.16 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.32 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.93 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  26.92 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  24.16 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  28.82 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.87 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  27.87 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  28.03 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  26.83 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.44 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  25.95 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  25.95 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  21.99 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  27.27 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  27.67 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  23.59 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  24.02 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  26.52 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.81 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.08 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  24.12 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  24.86 
 
 		 243 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  25.14 
 
 		 267 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  25.42 
 
 		 256 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  20.62 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  23.53 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.12 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  22.4 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1684  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.51 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.146126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  24.1 
 
 		 280 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  23.13 
 
 		 172 aa  42.4  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.5 
 
 		 212 aa  42  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  24.1 
 
 		 255 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  24.14 
 
 		 276 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  23.63 
 
 		 271 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  23.63 
 
 		 271 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>