64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0935 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  86.64 
 
 		 228 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  64.5 
 
 		 222 aa  294  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  58.03 
 
 		 218 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  58.03 
 
 		 218 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  59.78 
 
 		 210 aa  222  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  61.33 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  60.22 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.52 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  31.4 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.89 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  30.94 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  30.94 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.33 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  29.46 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  31.55 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  28.98 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.71 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  26.7 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  29.56 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  28.12 
 
 		 280 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  29.7 
 
 		 196 aa  85.1  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.28 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  27.32 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  28.12 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.24 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  26.34 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.93 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  23.25 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  24.3 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  25.86 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  22.89 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.4 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.4 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  28.85 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  23.42 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  28.4 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  26.35 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  27.56 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  22.88 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  28.14 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  27.56 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  25.15 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  26.92 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  23.08 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  26.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  26.92 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  27.54 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  26.92 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  27.27 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.71 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  23.12 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  25.64 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  22.92 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  23.72 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  21.21 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1495  hypothetical protein  27.52 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.635359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  21.21 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  22.3 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  23.12 
 
 		 181 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.75 
 
 		 214 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  23.33 
 
 		 180 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>