50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2763 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  90.21 
 
 		 214 aa  343  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  95.43 
 
 		 220 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  90.5 
 
 		 214 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  76.19 
 
 		 198 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  80.36 
 
 		 198 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  81.18 
 
 		 211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  61.11 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  50.47 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  49.72 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  55.81 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  47.88 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  44.22 
 
 		 197 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  39.9 
 
 		 228 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  43.5 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  42.11 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  42.6 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  41.34 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  38.55 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  27.93 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.62 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  27.93 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.01 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  28.79 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.99 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  27.56 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.01 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.85 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  23.81 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  25.82 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  24.14 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.77 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  26.83 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  31.82 
 
 		 173 aa  48.5  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  31.82 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  24.26 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  23.73 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  23.73 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  22.09 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.86 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  24.53 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  25.17 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.49 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  27.92 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  26.32 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.84 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  23.31 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>