39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3684 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  95.96 
 
 
272 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  90 
 
 
280 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  78.6 
 
 
276 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  72.95 
 
 
271 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  72.95 
 
 
271 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  69.2 
 
 
255 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  69.35 
 
 
256 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  75.34 
 
 
267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  48.37 
 
 
267 aa  195  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  47.39 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  43.61 
 
 
248 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.13 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  43.44 
 
 
271 aa  165  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  35.91 
 
 
243 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  26.56 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.92 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  26.56 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  27.6 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  30.73 
 
 
206 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.38 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  25.37 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.64 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  24.26 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.37 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  24.45 
 
 
218 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  24.45 
 
 
218 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  24.6 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  26.73 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.51 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.14 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.24 
 
 
201 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  25.44 
 
 
204 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  25.44 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  28.76 
 
 
195 aa  60.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  25.51 
 
 
196 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  24.31 
 
 
187 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  25 
 
 
197 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  24.32 
 
 
209 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>