38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0344 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  43.28 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  43.28 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  43.2 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  43.18 
 
 		 256 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  39.39 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  43.09 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  41.8 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  43.89 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  39.34 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.05 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  39.44 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  37.09 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.21 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  32.95 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  32.85 
 
 		 206 aa  85.5  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  27.89 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  27.89 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  26.73 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  31.94 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.84 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  25.12 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  25.53 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.63 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  25.61 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  26.22 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  25.15 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.43 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  27.62 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.12 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.87 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.47 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  25.15 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  24.02 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.32 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  23.81 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  22.61 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  20.48 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>