50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3300 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  68.45 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  54.24 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  51.53 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  53.14 
 
 		 194 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  46.84 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  53.99 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  48.62 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  48.62 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  52.17 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  50.3 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  48.48 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  46.55 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  49.38 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  42.51 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  44.68 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  49.71 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  42.02 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  42.33 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  37.29 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  29.31 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  29.63 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  27.1 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  27.1 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.15 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  25.15 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  24.85 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  24.86 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.03 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  25.53 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.55 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  26.81 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  22.52 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  26.35 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.68 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  21.85 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  21.48 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  19.28 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  23.7 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  26.17 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.57 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  26.59 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  21.29 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  19.16 
 
 		 248 aa  45.1  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.7 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  27.33 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.8 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1085  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.84 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>