29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2066 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 173 aa  352  1e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  97.69 
 
 		 180 aa  324  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  57.65 
 
 		 215 aa  193  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  32.61 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  31.88 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  29.29 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  26.81 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  27.2 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  26.81 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  30.6 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  27.87 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  26.81 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  29.11 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  27.87 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  28.69 
 
 		 211 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  31.82 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  31.82 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  21.74 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  25.36 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  30.68 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  26.09 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  30.68 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  25.41 
 
 		 214 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.07 
 
 		 209 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  25 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  23.57 
 
 		 232 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  21.95 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>